我国奶山羊饲养业存在系谱紊乱,近交阑珊,形状差、产奶量低一级工业化开展的难题,而优质的萨能奶山羊原种群及中心育种技能一向被国外奶山羊育种公司独占,我国无法进口。
为了破解奶山羊工业高水平质量的开展缺少良种的“卡脖子”问题,西北农林科技大学奶羊工业技能创新团队依托国家“948”项目、陕西省要点研制计划、陕西省奶羊工业技能系统、陕西省奶山羊饲养工程技能研讨中心,选用级进杂交与功用基因挑选相结合的现代分子育种新技能,培养适用集约化出产的优质高产奶山羊新种类,支撑我国奶山羊工业高质量开展。
在奶羊系统首席专家,团队负责人曹斌云教授的规划下,芯片技能负责人安小鹏研讨员与北京康普森农业科技有限公司联合开发了合适国内外奶山羊种类的中低密度育种芯片—“奶山羊20K育种液相芯片和5K选育液相芯片”。该芯片使用康普森CAGT®靶向捕获测序技能,完成基因组方针区域高效、精准、灵敏、低本钱定制基因芯片。适用于奶山羊种类血缘辨别、种类维护、亲子判定以及组成奶山羊功用符号数据库进行分子符号辅佐育种和全基因组挑选育种,为奶山羊种类选育作业供给有力的技能支撑和辅导根据。
奶山羊20K育种液相芯片位点来源于3个奶山羊种类的测序数据,从中挑选出个别间多态的位点,结合前期研讨中现已判定的重要经济性状要害候选基因符号,合计20000个位点,具有填充位点散布均匀、功用位点丰厚、检测本钱低一级优势。
芯片位点来源于奶山羊样本的测序数据,从中挑选取得20000个在29条染色体上散布均匀的SNP,而且保存的SNP为高频变异。
奶山羊20K育种液相芯片涵盖了山羊产奶、奶质量、形状相关以及成长、繁衍相关性状的5963个功用位点,促进对应性状育种发展。
5K选育液相芯片是在20k芯片的基础上开发的5k低密度功用芯片,交融了经挑选信号和GWAS剖析判定到的2632个与奶山羊重要经济性状明显相关的功用SNP位点,涵盖了产奶量、乳蛋白量、乳脂率、形状、繁衍、毛色等功用位点,这些位点的参加将促进对应性状育种发展。
该芯片包含了多个与重要性状相关的功用位点,结合奶羊团队多年来数据堆集,对奶山羊中心育种集体进行GWAS剖析,挑选到产奶量、乳蛋白量、乳脂量、产羔数、形状、毛色等多个性状功用基因和位点,可用于分子符号辅佐育种,在小羊时期进行前期选留和筛选。
根据国产化规划、检测和剖析流程,大幅度的降低分型本钱,选用自动化检测流程,提高检测通量和稳定性。
根据探针杂交靶向捕获测序技能,可以精确的经过需求添加符号位点,晋级芯片及扩展使用场景灵敏。
西北农林科技大学奶羊工业技能创新团队,负责人:曹斌云,成员:宋宇轩,安小鹏,李广,张磊,袁昊。团队首要致力于奶羊遗传繁育、精准养分等方面的研讨,掌管国家和省部级科研项目30项,获批省部级科技成果奖12项,在国内外宣布学术论文200多篇,授权国家发明专利16件。
为北京康普森生物技能有限公司的全资子公司,是一家专心于分子育种服务的国家高新技能企业,致力于使用基因科技和大数据赋能我国种业,为客户供给引种、育种、保种等多角度、全方位的种质资源优化解决计划。公司首要服务内容为个性化育种计划和选配战略拟定,全基因组挑选育种、种类判定、亲缘联系判定、功用基因检测、集体结构评价、当地遗传资源种类维护、地舆标识产品研讨开发等。
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