// 征集农业、食品企业案例，需在商业模式、技术、产品及市场等领域有特点、有创新。

  相较于种植业，我国养殖业的产业链各环节市场化、企业化、规模化程度更高，信息化基础也相对更好。尤其是，近年来种苗、饲料、养殖等产业链关键环节的市场集中度逐步的提升，上游企业不断大力推动如“公司+农户”等可复制模式，结合形式多种多样的金融手段，带着众多资源深入下游“养殖场”。

  同时，养殖业的模式升级，不仅推动平均养殖规模的上升，也提高了行业企业的运营、管理及科学技术水平，形成了良性循环。

  禽畜育种开始于对野生动物的驯养和驯化，至18世纪，英国的贝克韦尔（Robert Bakewell）开始系统地、科学地进行家畜改良和育种工作，在体质外貌选育的基础上，还根据生产性能、血统和后裔成绩进行选种，并结合采用近交方法培育了多种马、牛和绵羊良种，被认为是近代家畜育种的创始人。1900年孟德尔定律被三人（荷兰的狄夫瑞斯、德国的科伦斯和奥地利的切尔麦克）重新发现，现代遗传理论确立。1909年，丹麦遗传学家约翰逊（W Johansen）在《精密遗传学原理》一书中正式提出“基因”概念。至1930年代末，勒什（Jay Laurence Lush）在前人研究的基础上创立数量遗传理论，可应用于数量性状的遗传分析以及种禽畜育种值和选择效果等的估计，从而发展出一系列着眼于群体选种的理论和方法，推动了禽畜育种科学的发展。

  1944年，美国细菌学家艾弗里（Oswald Theodore Avery）证明 DNA是遗传物质。1953年，詹姆斯·沃森（James Watson）和弗朗西斯·克里克（Francis Crick）构建出DNA双螺旋结构模型。1960年代，分子遗传时代开启，遗传理论日益完善，遗传工程工具不断丰富（如MAS既分子标记辅助选择），加之体外受精和胚胎移植技术快速地发展，禽畜育种的影响力日渐增大。尤其是人工授精技术的推广，使种公畜所配母畜的数量和分布地区都显着扩大，加大了各公畜繁殖机会间的差异，进而增大了选择效果。

  1960年代，美国康奈尔大学的亨德森（Charles Roy Henderson）提出了线性育种理论“BLUP（最佳线性无偏预测）”，将统计、推断引入育种学。之后，计算机技术的发展及优化育种方案的研究，显着提高了遗传评估的准确性。同时，遗传工程工具的不断丰富，使MAS（分子标记辅助选择）等技术也在某些特定的程度上提高了选择的效率和准确性，尤其是SNP（Single Sucleotide Polymorphism，单核苷酸多态性）标记技术在基因技术和工具繁荣的基础上，开始引领当下禽畜乃至作物育种的风骚。

  截至目前，养殖育种体系已较成熟，牛（肉/乳）、猪、羊（绵/山）、鸡四大类都已具有完善的研究、开发、推广体系，其中又以奶牛行业最为成熟。需要我们来关注的是，基因组选择（Genomic Selection，GS）技术，已逐渐进入我国奶牛遗传评估体系，并渐渐成为主流。

  但，基因组选择在其他畜禽中的应用面临着诸多困难。其中，最重要的原因是应用成本仍然较高，畜禽全基因组标记测定成本比较高，且其他种畜禽的种公畜影响力较小，经济价值较低，在猪、鸡育种中采用基因组选择方法的经济回报远没有奶牛中那么明显。在基因型检测费没有降到足够“低”之前，低密度标记基因组选择方法的应用也有一定可能会给其他畜禽育种带来新的契机。

  在育种领域，生长速度、肉质、饲料报酬是禽畜养殖业的重要经济性状，但如何在三个性状之间寻找到最佳平衡点是个很复杂的工程，不同细分市场也都催生出不同的标杆企业及独特的商业模式。

  公司是世界上最大育种公司之一的“亚达遗传公司（Alta Genetics）”的全资子公司，是中国境内唯一的外商独资、国内最早开展基因组选择的种公牛站，北京艾格威畜牧技术服务有限公司提供合作支持。

  近年来，基因技术不断突破障碍，生物信息行业市场爆发，遗传物质资源及基因大数据必将是未来行业竞争的核心之一，观察亚达·艾格威的商业模式，可以为国内公司可以提供战略参考，也可为警钟。

  亚达·艾格威的核心产品为“种牛遗传物质”，其“亚达GPS”（Alta GPS，全称Alta Genetic Plan & Strategy，亚达遗传改良计划和策略服务项目）旨在为世界各地的奶农提供完整的、定制化的遗传改良计划，目前已被恒天然、华夏、辉山、澳亚等众多大型牧场使用。

  在遗传物质的基础上，亚达·艾格威还提供优势牛群偏差管理体系、个体选种选配、肢蹄保健服务，以及牧场管理和奶牛生产管理培训等服务，以及奶牛个体智能识别管理系统PCC、精准饲喂监控系统FeedWatch、奶牛场生产管理软件DC305等产品。

  “亚达GPS”的数据库基于5个国家的验证数据（美国、加拿大、新西兰、德国、英国），能添加其它国家验证信息（如澳大利亚、捷克共和国、爱沙尼亚、匈牙利等），针对牧场已经牛群的遗传现状，制定传改良计划，在基因科学、大数据等先进的技术的支持下，帮助牧场预估及实现遗传改良的效果和经济价值。

  在基因组技术方面，亚达·艾格威也处于全球领先水平。2009年，唐山市政府引进并建成亚达·艾格威唐山种公牛站，这是我国首家外商独资的种公牛站，其所采用的基因组选择技术至目前仍具有国际领先水平。

  此外，可关注加拿大爱德现代牛业（IND Lifetech），基于北美优质奶牛遗传物质资源、胚胎生物工程产业及XY性别控制技术，在全球及中国市场具有一定市场占有率。

  总体看来，我国奶牛种群改良工作仍然任重道远。1950年代，全球乳业强国已开始DHI（Dairy Herd Improvement，奶牛性能测定体系）的推广，目前已成为奶牛群体改良的基础工作。

  在我国，1993年6月，天津奶牛发展中心在日本的支持下率先在国内开展了DHI测试。1994年，“中国—加拿大奶牛育种综合项目”真正开始启动，次年分别在西安、上海、杭州三地建立了牛奶监测中心，开始实施DHI测试，后来北京也加入其中。1999年5月，中国奶协成立了中国荷斯坦奶牛全国生产性能测定工作委员会，进一步促进了DHI的推广和应用。2008年，我国开始推进《中国奶牛群体遗传改良计划（2008-2020年）》，截止2018年底，全国已建立37家奶牛生产性能测定中心，覆盖24个省，中国奶牛数据库迄今共收录奶牛生产性能测定有关数据7000余万条，为我国奶牛群体生产管理和遗传改良提供了强大的数据支撑。

  首农食品集团旗下“三元种业”是全国农垦现代农业示范区，以种牛、种猪的良种繁育为核心，以饲料加工、牧草种植、技术服务为辅，是国内领先的养殖一体化畜牧企业。三元种业拥有8个分子公司，41个规模畜禽养殖场含22个现代化牧场，奶牛存栏近9万头，拥有国家级奶牛良种繁育基地及国内一流的荷斯坦奶牛良种群，成母牛头年单产近11吨，处于国内领先地位。

  三元种业奶牛中心，自1973年建站至今，一直是国内奶牛育种的领先企业，其“基因组选择”技术体系及应用已较成熟。早在2001年，首农三元种业的“中国荷斯坦奶牛MOET育种体系的建立与实施”项目就曾获国家科学技术进步二等奖。

  截至目前，首农三元种业用自有近9万头母牛和超过400头验证公牛组成的基础数据库，构建成为规模超过6000头的我国主要的奶牛基因组选择参考群，创建了我国荷斯坦牛基因组选择分子育种技术体系，并提出了我国荷斯坦牛综合遗传评估的基因组性能指数（GCPI），研发了以基因组选择为核心的综合性分子育种方案，已在全国实施。

  目前，首农三元种业运用“基因组”选择技术，公牛的选择准确性已达到0.67-0.80，年遗传进展达到0.49遗传标准差，育种世代间隔由常规育种的6.25年缩短到1.75年，每头母牛的年产奶量提高了225Kg。2016年6月，首农三元种业联合首农畜牧、北京中地种畜、内蒙古优然牧业等七家行业有名的公司共同发起成立了“奶牛育种自主创新联盟”，致力于奶牛良种培育和推广。同时，三元种业自主集成创新形成了EDTM现代奶牛管理体系，包括奶牛环境控制（Environment）、奶牛生产数字化系统（DHI）、全混合日粮饲养技术（TMR）、奶牛生产标准化管理体系等关键技术，适合北方大城市郊区的集约化奶牛生产模式。

  随着新西兰A2奶在国际、国内的流行，国内也掀起了荷斯坦奶牛A2β酪蛋白检测热潮，三元种业奶牛中心借助完善的奶牛血统追溯及基因筛查体系，从266头荷斯坦种公牛中甄选出血统纯正的A2型种公牛103头，服务于市场需求。同时，助力兄弟公司三元乳品推出”三元A2β-酪蛋白纯牛奶“这款超高端牛奶，主打“亲和、源生、专属、稀奢”概念。

  受养殖政策影响，近年来我国生猪养殖行业的养殖模式快速变化，大型养殖场的增加及市场集中度的提升，直接将我国种猪育种技术拉至快速提升期。但，国内生猪种源长期依赖进口，育种企业多而分散，尤其是规模以下（年出栏500头）养殖户PSY（每头母猪每年所能提供的断奶仔猪头数）较国外仍存在一定差距。

  截止2019年底，国内生猪养殖业的平均PSY已经达到20.6的水平，领先的、规模化养殖企业的PSY可以达到24以上，但养殖技术水平较高的国家在2016年就已达到更高的平均水平，如：丹麦PSY已达30、荷兰PSY29、 法/德国PSY27、美国PSY25、英国PSY24、加拿大PSY23，新希望和天邦的PSY大约在27，牧原、温氏、正邦的PSY约为25。同时，国内规模化养殖企业在饲养效率、肉质及风味等方面也在快速提升，料肉比上升使得领先企业的完全养殖成本已降至约12.5-13元/kg，温氏股份大约为12.3元/kg，自建大场自繁自养模式的牧原股份在国内全行业最低，完全养殖成本约为11.6元/kg（2018年底数据）。2019年因非洲猪瘟影响，养殖成本（动保）有所抬升。

  回顾海外种猪育种发展历史，1985年以前，国外种猪通过表型数据和生产数据进行简单的选择；1985年，加拿大率先使用BLUP（最佳线性无偏预测）对猪进行育种，猪的背膘厚（衡量瘦肉率）、达100kg体重日龄（衡量生长速度）的改良速度均大幅提高，育种进展速度明显提升。之后，上世纪90年代以来，育种的工作重点重新回归到了纯种选育，国外几大种猪育种公司分别进行了配套优化选育，各个品系只针对某几个特征进行选择选育，专门化品系也增加了系间选择的可能性，养殖选择更丰富了。目前，国内领先养殖企业已多采用三元杂交猪，而PIC已在推广养殖效益更高的五元杂交猪了（由大白、长白、杜洛克、皮特兰和梅山共同杂交而成）。

  进入新世纪，新技术在种猪育种上的运用也比较繁荣，对行业影响比较深刻当属基因组技术（Genomic Selection，GS），全基因组的选择的最明显的效果是提高选择的准确性，在国际上应用较早有独立组织/协会中的NSR（美国国家种猪登记协会）、政府介入的育种项目Dan Bred（丹育种猪 ）和商业化种猪龙头企业PIC等，国内应用较少，目前已有温氏股份、牧原股份、唐人神等在进行探索行应用。

  自2010年农业部实施全国生猪遗传改良计划以来，我国种猪育种技术快速提升。近年来，肉猪养殖企业的规模提升及集中，导致我国领先的生猪养殖（饲料）企业在上游种猪领域多有布局，且规模较大。

  如肉猪出栏第一的温氏股份（2018年销售商品肉猪2229.72万头）已建成专业化的种猪科技公司，拥有顶尖的人才团队及行业唯一的国家生猪种业工程技术研究中心创新平台。温氏种猪公司体系健全，依托于大数据、信息化、丰富种质资源和精细化育种技术路线，采用“定制化”的育种思路，年产纯种猪12万余头，形成对饲料、养殖业务的有力支撑。

  2018年，牧原股份共销售生猪1101.1万头，其中商品猪1010.9万头，位居行业第二，并仍处于高速增长阶段。牧原股份现拥有2个国家生猪核心育种场，3个二元扩繁场，曾祖代核心群超过8000头，年测定纯种猪2万头以上，测定父母代种猪8万头以上，商品猪肉质测定1000头以上，年可供二元母猪超过30万头，纯种猪超过10万头，自有80余个猪场，累计超过150万头猪的数据，并建立起以终端消费市场/商品猪质量为方向的育种体系，致力于猪肉品质的改善，育种理念相当先进。

  其他领先的种猪企业包括正大集团、中粮肉食、正邦科技、天津宝迪、雏鹰农牧、广西扬翔、唐人神、顺鑫农业等。

  目前，限制全基因组选择在猪育种方向应用的最重要因素就是成本，启动费用大约25万美元，每年费用大约54万美元。在现实应用中一般通过新的基因型分型策略来解决成本过高的问题，例如使用低密度芯片与高密度芯片结合测定基因型，采用基因型填充技术，把低密度标记填充为高密度标记，或者开发新的基于测序的全基因组SNP分型方法，如GBS技术或极低覆盖度重测序技术等。且，随着商业化高密度SNP芯片的普及和二代测序价格的下降，基因组技术在种猪育种方面的应用必定会越来越多。

  以猪为例，已有多种不同密度的商业化SNP芯片（60K以上），其中Illumina、GeneSeek和Affymetrix公司的芯片应用最为普遍，然而这些SNP芯片主要是根据国外瘦肉型猪种（如长白猪、大白猪、杜洛克猪、皮特兰猪等）的简化基因组测序数据而设计，并不适用于我国地方品种。2017年5月，时任中国农业大学动物科技学院的刘剑锋教授团队研制的新款猪55K SNP芯片投入生产使用，这款芯片在中外猪种全基因组重测序、多组织转录组和蛋白组图谱构建的基础上，整合现有重要经济功能基因的公开报道的候选位点，并加入72个我国部分地方猪种特有SNP。目前，该团队正于深圳金新农合作开发、推广猪基因组选择的联合评估系统，并在6家生猪国家核心育种场实施基于基因组选择策略的区域性联合育种。

  种猪行业的标杆是PIC，1962年创建于英国，是英国上市公司Genus的子公司，是世界上最早专业从事种猪改良的公司之一。经过近50年的发展，PIC在全球设立了30多个合作公司，年销售种猪300多万头，是全球最大的种猪改良公司，全球种猪市场占有率达25%。PIC中国公司成立于1996年，总部设立在上海，在北京和成都设有分公司，在全国范围内拥有七个核心场和十余个扩繁场，年销售种猪8万余头。

  PIC拥有全球最大的猪育种数据库，包括超过2000万头猪的谱系信息，27个世代的完整系谱，900多万头猪的性能测定记录，涉及的性状多达45个，常规应用的分子标记己达185个（截止2007年3月31日），另有大量的候选分子标记在测试和检验之中，每天要为230万头猪估计育种值，其五元杂交体系也使杂交优势利用更为充分。

  至今，鸡的驯化史还没有达成一致结论。主流观点认为，大约8000年前，南亚的居民就开始驯化肉鸡的祖先“红原鸡（Gallus gallus）”，但之后几千年间，蛋鸡才是主流。

  现代育种业发展过程中，1930年代之前，鸡主要开展群体选择和无系谱记录的纯系的培育，主要选择的是产蛋性能，鸡肉是副产品；1940年代开始使用系谱记录；1930至1950年代，开始采用纯系杂交的方法提高鸡的成活率和繁殖性能。1946年，美国农业部主办的“明日之鸡”（Chicken of Tomorrow）竞赛，成为肉鸡崛起的导火索，这项历时两年余、席卷全美的竞赛，旨在鼓励农民饲养出体型更大、含肉量更高的鸡，也确实如愿以偿。

  1950年代开始，美国率先将海选出的优胜鸡种开始工业化养殖，随后的1960至1980年代，育种选择的方向也主要是易测量的性状，如产蛋量、孵化率、生长速度和饲料转化率等。20世纪90年代以来，加工性状受到重视，BLUP开始应用。进入新世纪，分子遗传学的发展和鸡基因组草图的绘制为鸡的育种提供了更大想象空间。鸡是世界上第一个完成基因测序的农业动物。

  目前，在全球各地的养殖场中，随时都有大约230亿只鸡正等待着被人类享用，其中72% 的肉鸡是在工厂化的农场饲养的，美国则有97% 的肉鸡是工厂化饲养的。相比而言，全球数量最多的鸟类是非洲的红嘴奎利亚雀（Quelea quelea），总数大约只有100亿只，地球上所有其他鸟类的体重总和也远不及我们每年吃掉的鸡的重量。2016年，全球被宰杀的家鸡数量有658亿只，是食用量最大的肉类，猪和牛的年屠宰量分别只有15亿和3亿只。

  国际上蛋鸡的良种基本上垄断在美国海兰（HY-LINE）和德国罗曼（LOHMANN）两大集团手里，国内祖代蛋种鸡企业十余家，之前多从国外引种。值得注意的是北京市华都峪口禽业已成长为世界三大蛋鸡育种公司之一，拥有原种7万只，祖代40万套，父母代450万套。2018年，中国农业大学联合北京首农食品集团旗下峪口禽业研发出首款国产蛋鸡育种专用基因芯片“凤芯壹号”，为基因组技术在国产蛋鸡育种中的应用奠定了基础。另如重庆丰都华裕、北京中农榜样、上海家禽育种、河北省大午农牧也均已培育出自有品种。2018年，国内自主培育的蛋鸡品种已占比65%左右。

  美国海兰创建于1936年，第一个使用杂交原理培育商品蛋鸡，并最早利用特定血型开展育种工作以提高生产性能，最先研制出白壳商品雏鸡羽速鉴别方法，第一家消除禽类白血病病毒，在全球蛋鸡育种市场占据绝对优势（市占率超70%）。2016年，美国海兰收购河北华裕农科部分股份。之后，华裕农科开始快速扩张，目前，饲养祖代种鸡12万套，父母代种鸡300万套，年可生产雏鸡2.5亿只。

  我国的肉鸡养殖以快大型肉鸡为主，从羽毛颜色上可分为白羽和有色羽两种，且以白羽肉鸡为主。

  2017年之前，全球白羽肉鸡育种由安伟捷（Aviagen）、科宝（Cobb）、哈伯德（Hubbard）三家巨头垄断，如2015年，全球祖代鸡产能约700万套，其中安伟捷350万套、科宝280万套、哈伯德50万套，共占据超过97%的市场份额。2017年7月， 安伟捷协议收购哈伯，全球白羽肉鸡育种呈安伟捷与科宝双寡头竞争格局。

  2010、2011年白羽肉鸡行业景气，带来国内祖代鸡引种的快速上涨，2011年-2013 年引种继续增长，产能严重过剩。为规范行业发展，2014年1月，益生股份、民和股份、圣农发展等业内企业一同成立白羽肉鸡联盟，加强行业源头祖代鸡引种管理，改变了行业引种的无序状态，引种量由历史高峰2013年的154万套下降至2014年118万套。2015年受海外禽流感疫情影响，促进了白羽鸡行业的被动去产能（引种量降至69万套），进而实现了行业的复苏。2016年11月，国内最大的祖代白羽鸡养殖企业“益生股份”从法国哈伯德（Hubbard）引入曾祖代，成为国内唯一一家拥有白羽鸡曾祖代的养殖企业，打破了国内祖代引种完全依赖于进口的局面。2018年，益生股份（哈伯德）在国内白羽肉鸡育种市场中的份额占比达到40%左右，哈伯德借益生股份之手反超原本领先的安伟捷的 AA+（爱拔益加）和罗斯。

  截至目前，我国白羽肉鸡育种市场仍然依赖海外引种。但根据《全国肉鸡遗传改良计划（2014—2025）》，到2025年要培育肉鸡新品种40个以上，自主培育品种商品代市场占有率超过60％，相关工作正在陆续展开。黄羽鸡以我国传统品种为主，养殖、加工及消费也是国内为主，育种模式主要是学习、复制白羽鸡的路径。

  我国肉鸭品种资源丰富，但多没有经过系统化选育，不能进行现代化商品生产。目前通过国家审定的仙湖肉鸭配套系、三水白鸭配套系、Z型北京鸭配套系、南口1号北京鸭配套系，虽然每年都有遗传进展，但是与国外引进的良种相比，在生长速度、瘦肉率、饲料转化效率和产蛋量等关键指标上还有很大差距。

  樱桃谷农场创建于1959年，总部位于英国林肯郡（Lincolnshire）的罗斯韦尔（Rothwell），其白羽肉鸭在全球市场占有率第一，原始种源来自我国特有的北京鸭（Pekin-duck），后被其改良培育后注册了基因专利，之后迅速成长为全球最重要的肉鸭品牌“樱桃谷”。樱桃谷农场在全球市场的占有率超过52%，在我国肉鸭市场的占有率超85%，全球每年消费超25亿只“樱桃谷鸭”。

  2017年9月，首农股份与中信农业联合以1.83亿美元的价格收购英国樱桃谷农场有限公司100%股权，终于将北京鸭（Pekin-duck）的品种所有权收归国内，此次收购也是国内动物育种行业第一次跨国收购。

  美国枫叶农场（Maple Leaf Farms）位于印地安纳州（Indiana）靠近大湖区,于1958年建场，是北美也是世界上最大的养鸭场，拥有完整的产业链，拥有“枫叶鸭”品种，年产肉鸭1500万只，占北美70％、美国80％的市场占有率。2010年，公司在中国山东省肥城设立外商独资企业，建立合资种鸭场，高调进入中国。目前，美国枫叶农场与南京桂花鸭集团合资组建了江苏阿米娅投资有限公司，其生产的阿米鸭（桂花鸭）已经走进美国市场，售价高达368元/只，为国内肉鸭养殖、加工企业提供了良好的借鉴案例。

  法国克里莫（ Grimaud）成立于1966年，以肉鸭（奥白星、番鸭、骡鸭）、鹅（朗德鹅、莱茵鹅）、兔（伊普吕）、鸽（欧洲肉鸽）、珍珠鸡育种为主，其水禽育种在国际上处于领先地位，种鸭在欧洲市场占主导地位。1996年10月，在成都设立祖代种鸭公司。2006年之前，我国番鸭和朗德鹅的种源基本都是从克里莫进口的。对于著名美食鹅肝来说，之前主要的生产品种是图卢兹鹅，原产于法国南部的图卢兹市郊区，是世界上体形最大的鹅种。目前，生产鹅肝的主要品种是法国克里莫公司的朗德鹅。

  我国（全球）最大的鸭苗企业是广西桂柳集团，父母代种鸭存栏700多万羽，可实现年产商品鸭苗10亿羽以上，肉鸭屠宰能力超7000万羽。

  我国的华英农业号称“世界鸭王”。公司起步于我国和英国樱桃谷鸭的合作项目，于上世纪90年代初于河南成立，2002年1月21日完成股份制改造，2009年12月16日于深交所中小板挂牌上市。2016年起，公司坚定延伸鸭上下游产业链，目前已拥有“育种-养殖-屠宰-加工”完整产业链，并采用“公司+基地+农户”的养殖外包模式快速扩张规模，向1.5亿羽自繁自养商品鸭的目标迈进。

  Illumina是全球基因产业龙头，其创新的基因测序和芯片技术正在推动生命科学研究、转化和消费者基因组学以及分子诊断中的突破性进展，从人体癌症研究到农业，Illumina提供一系列分析遗传变异与功能的测序及芯片解决方案。

  公司在基因行业上游的测序仪、试剂及耗材供应领域占据绝对垄断地位，目前已占据全球基因测序仪70%以上的市场占有率。在奠定上游基因测序仪的垄断地位后，Illumina一直在布局中下游的基因测序服务：NIPT、肿瘤、生物信息以及消费级应用是其布局的四大重点方向。世界各国众多实验室及基因服务企业都是在Illumina的产品及服务的基础上进行各种，如下文提及的康普森生物、天津生物芯片等公司。

  在农业领域，Illumina自2010年以来逐步扩大合作及应用场景范围，截至目前，Illumina已商业化的农业应用包括：基因组选择/性状筛选、分子标记辅助的回交、亲子关系鉴定、可追溯性、基因组选择和育种、转基因鉴定、传染病检测等，并在大熊猫、乳/肉牛、水稻、大豆等动植物的基因测序及分析领域做出了很大的基础研究工作。

  Illumina的激光共聚焦微珠芯片平台为全世界的科研用户更好的提供了最为先进的SNP研究平台，也为育种行业提供了一个强有力的工具平台。Illumina的SNP芯片有两类，一类是基于infinium技术的全基因组SNP检测芯片（Infinium Whole Genome Genotyping），另一类是基于GoldenGate特定SNP位点检测芯片，根据研究需要挑选SNP位点制作成芯片（48-3072位点）。

  Illumina Infinium芯片是基于微珠的BeadArray生物芯片，微珠是芯片的核心部分，每个微珠的表面偶联了几十万条相同序列的DNA片段，每个DNA片段的长度是73个碱基，分成标签序列和探针序列，是针对某一个特定物种的SNP位点设计的，作用是与目标DNA进行互补杂交。目前，Illumina可提供的动物SNP基因分型芯片涵盖牛、羊、猪、猫、狗、鸡、鹿和大山雀等物种，并可为其他物种进行SNP芯片订制。

  iPlant奶牛养殖需要参考很长一段时间里的大量数据，也就从另一方面代表着大数据变得很重要，而其中获取整个基因组的遗传变异是真正的制胜法宝。设在美国德克萨斯高级计算中心（Texas Advanced Computing Center）旗下的iPlant，是一个植物与动物的生命科学分析和大数据平台。该平台的科学家能够准确的通过奶牛的基因组序列来预测奶牛的产奶量，精度是其他技术的三倍，而成本只有1/20。且，可在奶牛出生后既提供预测。

  2017年，全球农业生物芯片行业的规模达到约1.1亿美元，领先企业大多分布在在美国和欧洲，包括Illumnia、Affymetrix（昂飞）和Agilent（安捷伦）等。

  国内的其他生物芯片公司还有如南京大渊、西安联尔科技、上海博星等，但多以人类应用为主，关注农业应用方向的较少，仅有如康普森、天津生物芯片、派森诺、菲沙基因等数家。

  北京康普森生物创建于2011年，致力于开发符合我国农业产业体系和物种的系列基因芯片，满足动植物品种鉴定、良种选育、性状筛选等需求，将基因组技术落地到农业生产中。

  康普森是国内业内较早的基因芯片检测服务商之一，建有标准生物实验室，先后引进美国Illumina公司的IScan基因芯片检验测试平台和高通量测序平台、Thermo Fisher公司的7G卡式基因芯片检验测试平台和GeneTitan高通量基因芯片检验测试平台、MassARRAY-核酸质谱分析平台、KASP-基因分型平台、Real Time PCR平台、人类健康基因检验测试平台以及各种配套设备等，公司还配备有Beckman FX系列自动化工作站，日检测样本量可达1000个以上。

  康普森研发的猪育种50k芯片“中芯一号”是国内首款自主研发的猪育种芯片，不仅打破了国外的技术垄断，更涵盖了亚洲猪种特异的SNP位点，为更快、更精准地选育出属于我国自己的高品质肉猪助力。

  康普森和中国农业大学联合研发的鸡育种芯片“凤芯一号”，是国内首款针对中国蛋鸡品种的基因分型芯片，着重关注产蛋、抗病、饲料利用率、蛋品质等经济性状。2018年4月21日，由康普森生物、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所、广东温氏南方家禽育种有限公司、江苏立华牧业股份有限公司等八家单位联合发起的“肉鸡全基因组选择育种联盟”在北京正式成立。

  此外，如天津生物芯片，由天津中新药业、南开大学、天津市创业投资有限公司、天津经济技术开发区国有资产经营公司共同出资组建，主要是做微生物检测芯片的研发、基因组学和功能基因组学研究。公司是“十五”期间国家863专项资助的五个生物芯片研发基地之一，并且是致力于病原微生物检测生物芯片研发的基地，在世界微生物检测生物芯片技术领域及基因组学、功能基因组学研究领域处于国际领先水平。近年来，公司在基因组学领域不断进行技术储备和平台更新，目前服务项目包括基因组学、蛋白组学、生物芯片、生物信息学、微生物鉴定、多克隆抗体定制等6大项共68小项。

  2008年，天津生物芯片与美国夏威夷大学合作完成了国际上首个转基因组植物木瓜的基因组测序；2019年初，公司与中科院海洋所、深圳农业基因组研究所、南开大学等单位合作获得了国际首个高质量对虾基因组参考图谱。

  锐翌生物科技集团于2014年在上海浦东新区创建，是国家批准成立的专业基因科技及健康服务企业。公司目前已在济南、深圳、杭州等地成立分部，旗下现有锐翌基因、锐翌医学、锐翌农业三大品牌。

  锐翌农业专注于畜牧业领域的高通量测序和生物信息分析服务，围绕精准畜牧产业，深耕“畜牧+基因”的创新科技领域。目前，锐翌生物与深圳金新农科技股份有限公司（002548）深度合作，双方将重点培育孵化畜牧业菌群、营养、疾控三大类前沿诊断技术、产品和服务，围绕精准畜牧产业，深耕“畜牧+菌群”的创新科技领域。

  在海外，已有Seres Therapeutics、Second Genome等一批知名微生物组领域勇于探索商业模式的公司，业务模式与锐翌生物相似。